Todas las líneas aprobadas por la UHE se desprenden de la macrolínea institucional denominada «Antropología y Desarrollo Sostenible», que a su vez, ordena los propósitos particulares de cada una en consonancia con el Ideario de la Universidad. Estas pueden ser interdisciplinarias, multidisciplinarias o transdisciplinarias, de acuerdo con los objetos de estudio y la naturaleza epistémica de los problemas heurísticos y complejos de los saberes implicados.